国内注册是由国家局及其派驻企业所在地的分支机构,按照国内有关卫生规范和要求对申请出口的食品加工企业进行考核、评审、认证，国外注册则是由进口国官方派出兽医卫生官员按照进口国的卫生规范和要求对出口国有关出口企业和安全卫生保证体系进行考核、评审、认证。凡申请国外注册的出口食品加工企业必须首先获得国内注册，国外注册由国家局统一向国外办理。