对自然保护和保存生物多样性领域里的持续发展来说，重要的是1992年在里约热内卢通过的带有不仅保护和保住，而且也要持续地利用生态多样性这个双重目的的关于生态多样性的国际协定。随着这个公约在德国坚定不移的贯彻落实，遏制了特别在最近50年内出现的野生动物和植物种类及其生存空间的减退，以及动植物基因资源的损失。

自然保护的首要任务是，保住尚存的自然或接近自然的地区，如有困难则通过自然化措施恢复此类地区，将它们联成一片并减少有害物质损害的影响。目前在德国大约有5000处自然保护区，占德国面积的1.8％左右和6000多处风景保护区，约占德国面积的25％。此外还有约占总面积2％的13座国家公园，其中占北海和波罗的海浅滩和水域的80％。以面积而论较自然保护区更重要的是风景保护区，其中几个已联合成为67个大面积的自然公园。和在自然保护区中的情况不同的是，在这里从事农业以及用于休闲目的都有规定。

在欧洲联盟动植物区系栖息地方针的框架内，规定了开创全欧范围内的群落生境混合体系（2000天然计划），它也将使各保护区之间有可能进行遗传学方面的交换。在联邦德国各州正在谋求生态方面重要地区的联合，它大约占面积的10％。除此之外，德国积极参与国际自然保护协议的签订、落实与进一步发展。